En lo referente a sus funciones, de acuerdo con el manual administrativo interno, la Unidad de Género de la Alcaldía Cuauhtémoc tiene dos mandatos constitutivos: 1) transversalizar la perspectiva de género en los procesos de planeación, ejecución y evaluación de políticas pública, estrategias, programas y acciones, así como 2) institucionalizar dicho enfoque a través de la creación de mecanismos formales que inciden directa e indirectamente en la cultura organizacional, de modo que pueda trascender con el paso del tiempo.

Asimismo, en el marco normativo de La Ley Orgánica de las Alcaldías de la Ciudad de México, se establece en su artículo 71 fracción XIII que las alcaldías deberán contar con una unidad administrativa de Igualdad Sustantiva, anteriormente llamada Unidad de Género. Asimismo, en su artículo 20 fracción V establece como finalidad de las alcaldías garantizar la igualdad sustantiva, y determina que estas deberán impulsar en las políticas públicas y los programas, la transversalidad de género para erradicar la desigualdad, discriminación y violencia contra las mujeres.